故事发生在一所名叫第3新东京世立NERV学园中，校长是严肃又寡言的碇原度（立木文彦 配音）。作为校长的儿子，碇真嗣（绪方惠美 配音）感到压力很大。于此同时，来自外国的红发转学生明日香（宫村优子 配音），分裂成三个、以姐妹的形式出场的凌波丽（林原惠美 配音）都给碇真嗣的学校生活带来了翻天覆地的变化。此外，在原作中高大帅气的初号机，也将以娇小可爱的形象，作为学院的一份子出现在动画中。 动画以《新世界福音战士》中的角色为原型，一改原作沉重严肃的气氛，描述了轻松愉快的校园生活。制作方首次采用了3D的Q版造型，配以实景背景和2D拼接，造就了多元化的绘画风格。
演员：高山南 山崎和佳奈 神谷明 小山力也 林原惠美 山口胜平 田中秀幸 岛本须美 绪方贤一 堀川亮 松井菜樱子 宫村优子 岩居由希子 大谷育江 高木涉 高岛雅罗 堀之纪 立木文彦 小山茉美 三石琴乃 置鲇龙太郎 日高法子 池田秀一 古谷彻
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演员：坂本真绫 宫野真守 松风雅也 铃村健一 藤田圭宣 斋藤彩夏 桐井大介 吉住梢 子安武人 土井美加 井上和彦 京田尚子 立木文彦 井上喜久子 乡里大辅 渡边启 根谷美智子 上田祐司 间宫胡桃 山崎树范 羽多野涉 竹内顺子 门胁舞以 桑谷夏子 田坂秀树 鸟海浩辅 梶裕贵 小林和矢 渡边智美 成田纱矢香 椿理沙 石塚小夜里 浅井清己 三瓶由布子 高垣彩阳 小野凉子 斋贺光希 山田美穗 笹本优子 长岛雄一 田村由香里 浪川大辅 羽鸟靖子 泽木郁也 佐藤蓝 鱼建 仲野裕 长嶝高士 星野充昭 川上伦子 岩尾万太郎 目
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